Malatya, akarsu ve diğer su kaynakları bakımından çoğu illerimize göre daha zengindir. Yer aldığı Fırat Havzası, Türkiye'nin en büyük havzasıdır. Su toplama alanı 127.000 km2 olan bu havzanın yıllık ortalama su hacmi 28 milyar mü aş­maktadır. Malatya, Tohma ve Tohma'nm kolları olan akarsular ile sulanır. Bütün bu akarsular, Tohma koluyla Fırat Nehri'ne dökülür.
   

    Tohma Çayı
   Malatya'nın en büyük suyudur. Yaz ve kış suyu boldur. En uzun kolu, Uzun Yayla'dan doğan Yukarı Tohma'dır (Ayvanlı Tohması). Diğer bir kolu, Tahtalı Dağları'ndan doğan Hacılar Tohması'dır. Bu iki büyük kol, Mığdı Düzü'nde birleşir­ler. Ovayı batı ve doğu yönünden geçen Tohma'ya, kuzeyden Halavun çayı ile Epreme Çayı; güneyden Dipsiz Çay, Sultansuyu, Beylerderesi, Horata Çayı, Orduzu Çayı karışmaktadır. Bu kollardan gelen su ile büyüyen Tohma, Fırat'a dökülür.
 

   Fırat Nehri
  Fırat Nehri, Karakaya Barajı yapılmadan önce Malatya-Elazığ ile Malatya-Diyarbakır sınırını çizen en büyük suydu. Kuruçay ile Tohma Çayı'nın bol suları da bu nehri besliyordu. Karakaya Barajı'nın bu nehir üzerine yapılmasından sonra nehrin yatağı geniş bir göl haline gelmiştir.
  

     Kuruçay
  Hekimhan ilçesi yakınlarında bulunan Hasançelebi ve Alacahan arasındaki Zorbaba Dağı'nın eteklerinden çıkar, Karakaya Baraj Gölü'ne karışır. Yaz aylarında genellikle kuruduğu için Kuruçay adını almıştır.
  

    Sultansuyu
  Doğanşehir ilçesinin batı sırtlarından doğar. Doğanşehir Ovası'ndan geçerek kuzeye doğru akar, doğudan gelen küçük bir su ile birleşir. Ova boyunca kuzeye doğru giderek Tohma Suyu'na karışır. Bu su üzerinde Sultansuyu Barajı inşa edil­miştir. Ünlü "Sultansuyu pirinci" de bu su ili sulanan topraklarda yetişmektedir. Bu su içerisinde bol miktarda gümüş balığı yaşamaktadır.
  

    Beyler Deresi
   İlk kollarını Pınarbaşı, Beydağları diplerinden alır. Önemli bir kolu Derme Suyu'dur. Bu kol, ilimizin kuzeyinde dar bir boğazdan, yıkık bir Bizans kilisesi­nin bulunduğu yerden doğar. İl merkezine 8 km uzaklıkta bulunan Yeşilyu/tan Eski Malatya'ya (Battalgazi), Taftan Milli Yazıları'na(düzlüğüne) doğru akmak­tadır. Böylece çevrenin kaynak sularından da yararlanılarak büyük bir alanın sulanması sağlanmıştır. Derme Suyu'ndan il elektriğinin bir bölümü elde edilmektedir. Beyler Deresi adıyla anılan bu sudan, bağ ve bahçelerin sulanmasında da yararlanılmaktadır.
   

    Derme Suyu
  Doğanşehir ilçesine bağlı Sürgü kasabası yakınlarındaki Takas adı verilen mesire yerinden çıkar. Göksu'nun önemli bir koludur. Sürgü Barajı'na dökülür. Bu suda önemli miktarda alabalık yetişmektedir.
 

     Melet Deresi
   Mendol köyü ile Şahinoğlu arasındaki dağdan çıkar. Suçatı Suyu ile birleştikten sonra Sultansuyu'na karışır. Bu suda sarı sazan balığı bol olarak bulunmaktadır.
  

     Orduzu Çayı (Elmasuyu)
  Küçük bir sudur. Yörediki arazilerin sulanması işlerinde kullanılır.
 

    Horata Suyu (Çayı)
  Yeşilyurt yolu üzerinde bulunan Konak kasabasının Banazı köyünden çıkar. Suyun çıktığı yer ilkbahar, yaz ve sonbahar aylarında önemli bir mesire yeri olarak çok sayıda ziyaretçi çeker. İçimi güzel ve çok soğuk bir sudur. Kasabanın hem içme suyu ihtiyacını, hem de sulama ihtiyacını karşılayacak kapasitede bir sudur.
 

    Elemendik Suyu
  Malatya-Kahramanmaraş karayolunun 20. kilometresinden çıkan bu su, biraz ileride Sultansuyu ile birleşir.
 

   Orduzu Suyu (Pınarbaşı)
  Malatya-Elazığ karayolunun 5. kilometresinden çıkar. Buraya Orduzu Pınar­başı denilmektedir. İlin en önemli mesire yerlerinden birisi olan Pınarbaşı'nda Malatyaspor Kulübü'nün spor tesisleri de bulunmaktadır. Suyun önüne bir de gölet yapılmıştır. Kışın burada biriken su ile yazın bağ, bahçe ve ekili alanlar sulanmaktadır.
 

    Şiro Çayı
   Pütürge ilçesinden geçer; ilçenin önemli suyudur. Adıyaman ilinin Kâhta ilçesindeki Kâhta Dağları'ndan çıkan bu su, vadilerdeki bahçelerde yer alan ağaçların sulanmasında kullanılır. Daha sonra Karakaya Barajı'na dökülür.DiğerleriYukarıda kısaca sayılan akarsulara şunları da eklemek mümkündür: Emir, Mircan, Göksu, Aksu, Benenyel, Söğütlüdere, Sazlıdere, Sotikdere, Kozlu Çayı, Yenice Çayı, Sertrek Çayı, Arapgir Çayı, Davulgan Çayı, Cevizlisu, Kırmehmet Deresi, Şişman Çayı, Gürpınar Çayı, Balıklaga Suyu, Sakızlı Çay, Yenice, Balaban, Ayvanlı, Kızılmağara, Kızılhisar, Karaçayır, Bıyıkboğazı, Valide Deresi, Kerek Çayı, Pereç Suyu.